学院与吉林省嘉博生物科技有限公司建立了产学研合作关系，企业每年为教师和学生提供实习和实践岗位。双方共同开展了以土壤面源污染防控为目标的新型肥料和生物菌剂的研制开发，学院负责提供菌种资源和技术支持，企业负责产品开发。先后开发了根际促生菌剂、高效生物接种剂生产工艺、新型溶磷菌剂及其清洁生产工艺等产品和工艺，合作申报并完成了5项省部级以上的科研项目和农业科技成果转化项目。完成了新型溶磷菌剂的田间示范、技术培训和基地建设等工作，并制订了在玉米生产上减施1/3化学磷肥的应用技术规程，建立了面积达200公顷左右的玉米和水稻示范区。在这些示范区先后进行了1000人次的应用技术培训.产品推广应用区覆盖吉林、辽宁、黑龙江、新疆和河南等5省，累积推广面积200万亩，作物平均增产10%以上，实现农民节本增收6000余万元。协助2家企业成为国家科技型企业；研发的秸秆腐熟剂等7个生物制剂产品在农业部注册登记；共同申报专利4项，获得吉林省科学技术三等奖2项。
近年来，学院与嘉博生物科技有限公司在已有合作的基础上围绕黑土保护重点开展了矿区迹地和边坡恢复与治理的新型菌剂研发工作，目前已完成优良菌种选育和中试实验。学院围绕菌糠资源化利用，研发了低成本、高效的菌糠基保水剂，研究表明该保水剂在农业生产上有巨大的应用优势，学院将菌糠基保水剂的专利转让给了长春茂丰肥料有限公司，双方在此基础上进一步开展了合作，成功将该保水剂应用于肥料的生产，制备保水保肥型缓释农用肥料。
