吉林农业大学环境科学与工程学科是在1986年授权的环境工程二级硕士学科的基础上发展起来的，至今已有30多年的历史，分别在2001年设立环境科学本科和2004设立环境工程本科专业，在2010年授予环境科学与工程一级硕士授权学科。目前，环境科学与工程学科现有教师22人，其中校内16人，校外6人，教师队伍年龄、职称与学历结构合理。

    本学科依托吉林省商品粮基地土壤资源可持续利用重点实验室、农业部农药残留登记实验室和农业资源与环境国家级实验教学示范中心，在农业面源污染控制、农业废弃物资源化利用、土壤农药和重金属污染毒理与修复以及黑土保护与可持续利用等方面形成了具有区域优势的研究特色。近五年来，承担国家自然科学基金、国家973计划前期、国家科技支撑计划、国家重点研发计划、吉林省重大科技计划等17项，省部级和重要横向课题及厅局级项目36项；总合同经费达1340万元，在国内外的重点期刊上发表学术论文 100余篇；获得吉林省科技进步二等奖和三等奖各4项、吉林省自然科学学术成果奖二等奖3项、大北农科技奖等其他科技奖6项；出版专著及授权专利12项。